特徴

統計解析の提示が効果的になる

こんな人におすすめ

  • データに対して、適切なグラフがどれかわからない
  • グラフの配色にいつも苦労する
  • 自由度と再現性の高いグラフを描きたい
  • Rでのデータ解析を勉強したい

充実のサンプルデータ

研究でよく使う形式のデータを提供しています。

tidyverse + ggplot2

データの整形、クリーニングをtidyverseで、基本の作図をggplot2で解説。一貫性のある方法で、再現性のある作図をわかりやすく解説。

系統樹やヒートマップの可視化も

多くのRの可視化本で含まれている基本的な図から発展的なグラフにも対応

ユニバーサルカラーデザイン

読みやすく美しいだけでなく、さらに色覚多型にも対応した作図方法も

ユニバーサルカラーのグラフが簡単に

ヒートマップによる相関図

非線形モデリング:回帰スプライン

傾向スコアのヒストグラム

回帰不連続デザイン

ファンネルプロット

ネットワークメタアナリシス

生存曲線

スパイダープロット

ROC曲線

ブランド・アルトマンプロット

webサイト特典

webサイト特典の利用には書籍(「はじめに」iii頁)に記載されたIDとパスワードが必要になります

サンプルデータダウンロードする

サンプルデータダウンロード

本文で利用したサンプルデータをダウンロードしてください。

Rファイルダウンロード

本文の図、ならびにトレーニングで利用したサンプルコードをすべてダウンロードできます。出力結果がうまくいかないときなど、確認のためにお使いください。

モノクロデザイン

本書で取り扱ったグラフのモノクロ化について解説する予定です。
coming soon

目次

Part1 Rの紹介と前準備

[1-1]RとRStudioの基本
[1-2]データのインポートと前処理
[1-3]ggplot2の基本
本書で使用するデータセット一覧
本書で使用するパッケージのインストールと呼び出し

Part2 相関と回帰分析の可視化

[2-1]相関係数のヒートマップ(Correlation matrix)
[2-2]回帰分析1―線形な関係(Regression analysis: Linear relationship)
[2-3]回帰分析2―非線形な関係(Regression analysis: Non-linear relationship)
[2-4]回帰分析3―点推定値と信頼区間(Point estimate and confidence interval)

Part3 因果推論の可視化

[3-0]因果推論の導入
[3-1]傾向スコア分析(Propensity score regression analysis)
[3-2]回帰不連続デザイン(Regression discontinuity design)
[3-3]差分の差分法(Difference in differences design)
[3-4]DAG(Directed acyclic graph)

Part4 メタアナリシスの可視化

[4-1]フォレストプロット(Forest plot)
[4-2]ファンネルプロット(Funnel plot)
[4-3]ネットワーク・メタアナリシス(Network meta-analysis)

Part5 生存時間解析の可視化

[5-1]生存曲線(Survival curve)
[5-2]スイマープロット(Swimmer plot)
[5-3]スパイダープロット(Spider plot)

Part6 臨床検査学・診断学の可視化

[6-1]ROC曲線(Receiver operating characteristic curve)
[6-2]ブランド・アルトマンプロット(Bland-Altman plot)

Part7 生命医科学の可視化

[7-1]次元圧縮(Dimensionality reduction)
[7-2]ボルケーノプロット(Volcano plot)
[7-3]系統樹(Phylogenetic tree)

BOX

1-1 RとRStudioの役割とメリット
1-2 SourceペインとConsoleペインの役割
1-3 Rコマンドの注意点
2-1 エラーメッセージの解決策
3-1 調整変数の選択方法~バックドア基準を基に~
4-1 ファンネルプロットが非対称性になるメカニズム
6-1 感度と特異度

Column

1 gtsummaryパッケージによる表での可視化
2 画像の保存形式(ビットマップ/ベクター)
3 記述統計に関する発展的な可視化
4 欠測値の可視化
5 データハンドリングのTips

索引
あとがき
著者プロフィール

連絡先

誤字・誤植、あるいは内容について質問があるという場合はこちらのフォームよりお問い合わせください。

※は必須項目です。